פרויקט MKUltra (המכונה לפעמים תוכנית בקרת הנפש של ה- CIA) הוא שם הקוד שניתן לתוכנית ניסויים בבני אדם, לפעמים בלתי חוקית, שתוכננה ונערכה על ידי סוכנות הביון המרכזית של ארצות הברית. הניסויים בבני אדם נועדו לזהות, לפתח סמים ונהלים לשימוש בחקירה ועינויים על מנת להחליש את הפרט לכפות וידויים באמצעות בקרת נפש.
המבצע החל בתחילת שנות החמישים, הוטל רשמית בשנת 1953, הוקטן בהיקפו בשנת 1964, הוקטן עוד יותר בשנת 1967, והופסק רשמית בשנת 1973. התוכנית הייתה מעורבת בפעולות בלתי חוקיות רבות, כולל שימוש לא מכוון ב אזרחי ארה"ב וקנדה כנושאי המבחן שלהם שהובילו למחלוקת בנוגע ללגיטימיות שלהם. MKUltra השתמשה במתודולוגיות רבות כדי לתפעל מצבים נפשיים של אנשים ולשנות את תפקודי המוח, כולל מתן סמוי של סמים (במיוחד LSD) וכימיקלים אחרים, היפנוזה, חסך חושי, בידוד, התעללות מילולית ומינית, בין שאר סוגי העינויים הפסיכולוגיים.
היקף פרויקט MKUltra היה רחב ומחקר שנערך ב -80 מוסדות, כולל 44 אוניברסיטאות, בתי חולים, בתי כלא וחברות תרופות. ה- CIA פעל באמצעות מוסדות אלה באמצעות ארגוני קו ראשון, אם כי לעיתים בכירים במוסדות אלה היו מודעים למעורבות ה- CIA.
פרויקט MKUltra הובא לראשונה לידיעת הציבור בשנת 1975 על ידי ועדת הכנסייה של קונגרס ארצות הברית וועדת ג'רלד פורד לחקירת פעילויות ה- CIA בארצות הברית. מאמצי החקירה נפגעו מכך שמנהל ה- CIA, ריצ'רד הלמס, הורה להשמיד את כל תיקי MKUltra בשנת 1973; ועדת הכנסייה וחקירות ועדת רוקפלר התבססו על עדותם המושבעת של המשתתפים הישירים ועל המספר הקטן יחסית של מסמכים ששרדו את צו ההרס של הלמס.
בשנת 1977, חוק חופש המידע חשף מטמון של 20,000 מסמכים הקשורים לפרויקט MKUltra, שהוביל לדיונים בסנאט בהמשך השנה. ביולי 2001 סווג מידע מסוים ששורד את MKUltra.