המונח מתודולוגיה מוגדר כקבוצת מנגנונים או נהלים רציונליים המשמשים להשגת מטרה, או סדרת יעדים המכוונת חקירה מדעית. מונח זה מקושר ישירות למדע, אולם ניתן להציג את המתודולוגיה בתחומים אחרים כגון חינוך, שם מתודולוגיה דידקטית או משפטית מצויה בחוק.
ישנם הקשרים רבים בהם ניתן להשתמש במילה מתודולוגיה; להבא, כמה מהם:
המתודולוגיה הדידקטית. זה קשור לכל מה שקשור לצורות או לשיטות ההוראה שמאפשרות את ההצלחה של תהליך ההוראה-למידה, שבמקרה זה תהיה השגת הידע הדרוש ללמידה, פיתוח והבנה של דרכים שונות ללימוד עבודה או מקצוע במיוחד. המתודולוגיות המיושמות בתהליך ההוראה הן: דדוקטיביות, אינדוקטיביות ואנלוגיות או השוואתיות.
באשר למתודולוגיה משפטית, ניתן להבין אותה כדיסציפלינה המקלה על הבסיסים הפילוסופיים המשמשים בתרגול מדעי המשפט.
מתודולוגיית פיתוח תוכנה מתייחסת למכלול הטכניקות, הנהלים והתומכים התיעודיים המשמשים בתכנון מערכות מידע. מטרתה העיקרית היא לחשוף סדרה של טכניקות דוגמנות מערכות קלאסיות ומודרניות המאפשרות פיתוח תוכנות איכותיות, הכוללות הוריסטיות בנייה וקריטריונים להשוואת מודלים של המערכת.
בין מתודולוגיות פיתוח התוכנה הנפוצות ביותר כיום הן:
מתודולוגיית ה- XP (תכנות קיצוני) מאופיינת בהיותה מהידועות ביותר בתהליכי פיתוח תוכנה זריזים, שכן היא שמה דגש רב יותר על יכולת התאמה, ולא על יכולת חיזוי.
מתודולוגיית Scrum. הוא מאופיין על ידי היותו מתודולוגיה זריזה וגמישה המאפשר ניהול פיתוח תוכנה, מנסה לעמוד ביעד שלה, וזה כדי למקסם את התשואה על השקעה שבצעה החברה. מתודולוגיה זו מבוססת על בניית הפונקציונליות החשובה ביותר עבור הלקוח ועל עקרונות פיקוח, התאמה וחדשנות מתמידים.
מתודולוגיית הידע, היא מורכבת מסדרת אלמנטים המאפשרים התכתבויות בין האדם לסביבתו. בתוכה ארבע שיטות כלליות להשגת ידע:
שיטת העקשנות: באמצעות הליך זה, הסובייקט מפסיק להאמין באמתו ומאמץ כנכון, את המסורת שמטילה קבוצה או גילדת סמכות. שיטת האפריורי או האינטואיציה: בשיטה זו מעריכים שאנשים מצליחים להגיע לאמת באמצעות תקשורת וחילופי רעיונות חופשיים; ובהיעדר הסכמה בין הצדדים, מתעוררת דילמה כאשר קובעים מי צודק.
השיטה המדעית: באמצעות שיטה זו ניתן לפזר את כל הספקות שהחוקר מציג, מכיוון שמתודולוגיה זו אינה מבוססת על אמונות, היא מתבססת רק על תוצאות המתקבלות באמצעות ניסויים. המדען אינו מקבל את אמיתות המידע, אם הוא לא בודק אותו קודם.
מתודולוגיית היסטוריה מוגדרת כסדרת טכניקות ונהלים המשמשים היסטוריונים לטיפול במקורות ראשוניים וראיות אחרות התורמים למחקר על אירועי עבר בעלי חשיבות רבה לחברות אנושיות.
מתודולוגיה מדעית, זו מוגדרת כנוהל החקירה המשמש בעיקר ביצירת ידע מבוסס מדע. זה נקרא מדעי מכיוון שמחקר כזה מבוסס על אמפירי ומדידה, תוך התאמה לעקרונות הספציפיים של מבחני הנמקה.
חשוב להדגיש כי בתוך כל המחקר המדעי ישנם ארבעה אלמנטים בסיסיים: הנושא (שמבצע את המחקר); האובייקט (הנושא להיחקר); הסביבה (מתייחס למשאבים הדרושים לביצוע המחקר); והסוף (קשור למטרה שאליה נחקרת החקירה)
