מולקולה אורגנית או תרכובת אורגנית הוא חומר שמקורו כימי המורכב מיסוד כימי הנקרא פחמן ומימן אחר. עם זאת, הוא מכיל אלמנטים אחרים אך בכמות פחותה כמו: חמצן, זרחן, חנקן, גופרית, בין היתר. אחד המאפיינים של היסודות הללו הוא שהם דליקים, כלומר, הם יכולים להישרף ולשרוף.
כדי להבין את המונח הזה קצת יותר, צריך לדעת שהמילה אורגנית מבחינה אטימולוגית מגיעה מאיברים וקשורה לחיים. במאה ה -19 הם נקראו אורגניים, הודות לסדרת אמונות בה הם טענו כי ניתן לסנתז אותם רק על ידי אורגניזמים חיים.
חשוב להדגיש שרוב התרכובות האורגניות מתקבלות באופן מלאכותי באמצעות תהליכים כימיים, אולם ישנם כאלה שניתן להפיק ממקורות טבעיים.
תרכובות אורגניות טבעיות הן אלה שמסונתזים על ידי בני האדם ונקראים ביו מולקולות. אלה נחקרים על ידי ביוכימיה והרוב המכריע נגזר משמן.
תרכובות אורגניות מלאכותיות הן חומרים שאינם מייצרים או שאינם קיימים באופן טבעי ומיוצרים על ידי האדם, דוגמה לכך היא פלסטיק.
כדי להבין קצת יותר את המונח הזה ואת הקשר שיש לתרכובות אורגניות בחיי היומיום, הנה כמה דוגמאות.
הרוב המכריע של הפחמימות מורכב מפחמן, חמצן ומימן, המכונים גם סוכרים, והם נמצאים בשפע בעולם הצומח, כגון עמילן, פרוקטוז ותאית.
באופן דומה, ישנם גם ליפידים שהם ביומולקולות המורכבות מפחמן ומימן ועם פחות חמצן. המאפיין העיקרי שלהם הוא שהם יכולים להיות מסיסים במים ומסיסים בממיסים.
אחרון חביב, חלבונים נמצאים והם בעלי חשיבות רבה ליצורים חיים.
מצד שני, ישנם תרכובות אנאורגניות, שבניגוד לתרכובות אורגניות, אינן מכילות פחמן המשתלב במימן. יתר על כן, היווצרותה תלויה בהתערבות של תופעות פיזיקליות וכימיות מסוימות לקיומה.