זהו חלל של המוח שדרכו מסתובב חומר כמו נוזל המוח. בשינה כוללת, שם הם 4 חדרי מוחות: שני חדרים לרוחב הממוקמים לאורך כול חץ כדור; מצד שני, חדר שלישי דק ושטוח ממוקם בין התלמוס; לבסוף, החדר הרביעי ממוקם בין גזע המוח למוח הקטן. כל החדרים הנ"ל קשורים זה בזה
מצד שני, חלל החדר ממשיך לחוט השדרה דרך תעלת האפנדימה, חלל קטן למדי שמתחיל בקצה החדר הרביעי ועובר דרך החלק הפנימי של חוט השדרה.
כאמור לעיל, החדרים מתקשרים דרך הפתח הבין -חדרי עם החדר השלישי, מבנה זה ממוקם ממש מתחת לתלמוס. בעוד שהחדר השלישי והרביעי שומר על תקשורת דרך אמת המוח. החדר הרביעי מחובר לחוט השדרה דרך תעלת האפנדימה. מבנה זה חוצה את כל החבל ומאפשר לנוזל מוחי לעבור דרך זה לחלקו הסופי של החדר הסופי שנקרא. בינתיים, החדר הרביעי מתחבר גם לארכנואיד דרך פתחי לוסצ'קה ומג'נדי, ובכך מאפשר להפיץ את נוזל השדרה בצורה נכונה בכל המוח.
למרות העובדה שחדרי המוח ומערכת החדר נתפסים כמערכת, הם עשויים להיראות כמו שאריות של התפתחות שאין לה פונקציות נהדרות, אולם האמת היא שהם אלמנטים חשובים מאוד ביחס לשמירה על הבריאות ומצב המוח.
תפקידי החדרים הם שונים, אולם ישנו אחד הבולט מעל השאר, זהו ייצור נוזל מוחי, יש לציין כי חומר זה מופרש גם בכמויות קטנות על ידי מבנים אחרים כגון החלל התת - עכבישי, אך באופן כללי, כמות נוזלי המוח שיש לגוף מופרשת על ידי מקלעות הכורואידים השייכות למערכת החדר.