כינין הוא תרכובת מסוג אלקלואיד, ממוצא טבעי, בעלת גוון צלול וגבישי, המאופיינת בכך שיש לה איכויות מסוימות, ביניהן משככי כאבים, נוגדי חום ואנטי מלריה, האחראים על ייצור חומרים אלה הם צמחים השייכים לסוג Cinchona. זה שימש כמרכיב העיקרי לטיפול במלריה, אך מאוחר יותר הוחלף על ידי חומרים סינתטיים עם רדיוס פעולה יעיל הרבה יותר, אם כי כיום ניתן להשתמש בשימוש במקרים של מלריה עמידה כשמדובר בזיוף של הרואין.
מאז גילויו על ידי האינדיאנים האמריקאים, כינין היה ידוע מאוד ביכולות הריפוי שלו, אולם בחברה האירופית הקולוניאלית השימוש בו לא הוכר עד שהוכח השימוש בו לטיפול במלריה. שימוש זה התגלה על ידי הילידים כאשר הכובשים האירופיים הביאו מלריה מ אירופה, זה היה רגע שבו הילידים גילו את ההשפעות של קליפת הצינצ'ונה העץ על מלריה. שם "כינין" נובע בניב קצ'ואה, במיוחד מהמילה הקינה כלומר לנבוח, מאוחר יותר בשם "כינין" ניתן הנביחה של טעם עץמר ועם תכונות ריפוי של מחלות שונות וכאן נגזר המונח כינין.
בשנת 1737 הצליח החוקר צ'רלס מארי דה לה קונדמין לגלות את אחת הצורות של כינין שהייתה היעילה ביותר כנגד מלריה, ולבסוף כמעט עשור מאוחר יותר בשנת 1820 הצליחו ג'וזף בינימה קוונטו ופייר ג'וזף פלטייה לבודד בשלמותו. לכינין, שלפני טיהורו היה אפשרי, היה צריך לייבש את קליפת העץ ואז לטחון אותו לאבקה דקה ואז לערבב אותו עם חומר נוזלי כלשהו ואז שיכור התערובת. למרות ההתקדמות הטכנולוגית הגדולה, המקור הידוע היחיד של כינין הוא עץ הכינין, אשר לאורך זמן הצליח לטהר עוד יותר את הסינתזה שלו.
השימוש בחומר זה ברמה תרופתית יכול לגרום למה שמכונה סינכרוניזם, לרוב כאשר המינונים הניתנים גבוהים מדי, ואף עלולים לגרום למוות של המטופל, מכיוון שהוא עלול לגרום להיווצרות בצקת בריאות., במקרה של נשים בהריון יכול לגרום להפלה.
