אתר שבו יש ריכוזים גבוהים של חומר זיהומי ידוע כמוקד זיהום, שיכול להתפשט לאזורים גדולים בהרבה, וההשפעה שלו בולטת הרבה יותר. בתחום הבריאות נעשה שימוש נרחב במושג זה כדי להגדיר את המקומות מהם מתפשטת מחלה או כל גורם זיהומי אחר.
הגודל מבחינת הממדים של מיקוד הזיהום יכול להיות משתנה מאוד, מכיוון שהוא קשור קשר הדוק לסדרת אלמנטים, כגון מקור הזיהום, ההסתברות שהוא יתפשט ו ההתקדמות שנעשתה ביחס לחקירת אותו.
מוקד של זיהום יכול להיות גם גדול וגם קטן, מכיוון שמצד אחד ניתן לומר שמוקד של זיהום יכול להיות קהילה שלמה או, אם לא, זה יכול להיות אדם יחיד, שהוא הנושא של פתולוגיה כלשהי של סוג מדבק ולגביו יש צורך לנקוט בצעדים סניטריים, שכן אחרת המחלה האמורה יכולה להתפשט להמונים גדולים ולהפוך למגיפה, מסיבה זו אמצעי מניעה עשויים לכלול בידוד של כל מגע אנושי של האדם האמור או של קבוצת האנשים הנושאים את הזיהום האמור, והכל במטרה שהנזק יהיה המינימלי ביותר.
באותו אופן, זה יכול לקרות עם אתר ספציפי, כלומר במקום ספציפי יש סוג כלשהו של נגיף, אותו ניתן לרכוש על ידי כל אדם שנמצא באותו מקום ולכן הזיהום הזה יכול להתפשט מהר מאוד אם לא זוהה בזמן
להיות מסוגל להיות בעל ידע לגבי מוצאם של מחלה היא בעלת חשיבות רבה, שכן בזכות הידע של זה אפשר להעריך את הפרוגנוזה של זיהום אמר, כמו גם כדי להסיק את הסוכנים זיהומיות הגורמות זה, וזה מאוד זה חשוב מכיוון שניתן לייצר בעזרתו מיקרוביאלים, באותו אופן הם יכולים גם ליצור אמצעים המתמקדים בשליטה ישירה על המוקד ולא על העברת המחלה.
