חריגות מולדות הן מומים מולדים, הפרעות או מומים מסוג זה. חריגות אלה יכולות להיות מבניות ותפקודיות כאחד, כך במקרה של הפרעות מטבוליות המתרחשות במהלך ההריון או הלידה.
עבור מקרים מסוג זה, כמעט בלתי אפשרי להקצות סיבה ספציפית מהסיבה שבגללה 50% מהחריגות המולדות. עם זאת, זוהו כמה מהגורמים או גורמי הסיכון שלהם, ביניהם:
גורמים סוציו-אקונומיים ודמוגרפיים: הכנסה נמוכה של משפחה עשויה להיות קובע בעקיפין, חריגות מולדות שכיחות יותר במשפחות ובמדינות בעלות הכנסה נמוכה. ההערכה היא שכ- 94% מחריגות כאלה, שהן קשות, מתרחשות במדינות בעלות הכנסה נמוכה, בהן לעיתים קרובות נשים חסרות גישה מספקת למזון מזין ועלולות להיכנס להריון בריא.
גורמים גנטיים: גורם חשוב בגורם זה הוא צמיחה, מכיוון שהיא מגדילה את השהייה של חריגות מולדות גנטיות נדירות וכמעט מכפילה את הסיכון למוות ילודים ותינוקות, כמו גם נכות שכלית וחריגות מולדות אחרות שיוצאות מנישואין. בין בני דודים ראשונים. לדוגמא, זו הסיבה שכמה קהילות ממוצא אתני, כמו יהודים אשכנזים או פינים, נמצאות בשכיחות גבוהה יותר של מוטציות גנטיות נדירות התנאים המוגדרים לסיכון מוגבר לחריגות מולדות.
זיהומים: עגבת ואדמת הם זיהומים אימהיים הגורמים לחריגות משמעותיות.
ניתן לבצע ניתוח ילדים וילדים עם בעיות תפקודיות כמו תלסמיה, מחלת מגל או תת פעילות של בלוטת התריס מולדת לטיפול בחריגות מולדות מבניות.