זהו חומר בעל יכולת להרוג חיידקים, מיקרואורגניזמים חד תאיים או אורגניזמים אחרים. קוטלי חיידקים יכולים להגיע בצורה של חומרי חיטוי, חיטוי או אנטיביוטיקה. כדי להבין את השימוש בחיידקים, ראשית עליכם להבין מהם חיידקים. לחיידקים יש את היכולת לשרוד כמעט בכל התנאים עלי אדמות, בין אם זה אדמה חמה ולחה או פסולת רדיואקטיבית שלא תהיה מסבירת פנים לאף אורגניזם אחר. חיידקים מסוימים עלולים לגרום נזק לבני אדם, בעלי חיים או צמחים, בעוד שחלקם עשויים להיות נחוצים להישרדותם של צמחים, בעלי חיים ובני אדם. בשל העובדהמכיוון שחיידקים יכולים לשרוד כמעט בכל התנאים, לעתים קרובות קשה להרוג אותם. לכן נוצרו חומרים כמו חיידקים כדי להרוג חיידקים מזיקים תוך שהם לא מזיקים לחיידקים הטובים החשובים.
משמשים לעתים קרובות כחומרי הדברה, חומרים אלה מורכבים בדרך כלל מדיו-דו - חמצני ומסייעים בסילוק חיידקים וריח. קוטלי חיידקים יעילים ביותר כאשר חיידקים נהרגים באזור סגור. מכיוון שהם אינם רעילים, הם אינם גורמים לשריפות או לפיצוצים. ניתן להתקין חומרים אלה אפילו במזגנים כדי להרוג חיידקים באוויר. לעתים קרובות עשוי גז יבש, חומרים אלה יש בדרך כלל פחות לחים לעומת אירוסולים נוזלים מסוגלים להרוג חיידקים בתוך פרק זמן קצר של זמן ללא פגיעה כל דבר אחר.
לרוב זמין כחומר חיטוי, אנטיביוטיקה או חומר חיטוי, ומשתמשים בו באופן שונה בצורות שונות. חיטוי, חיטוי בניגוד או אנטיביוטיקה, אינם מיועדים לשימוש בגוף האדם וכן להחיל משטחים הדומם כדי לנקות את המשטחים של כל מיקרואורגניזמים אשר עלול להיות בהם בהווה עלולה להזיק כאשר נוצר קשר. דוגמא קלאסית לחומר חיטוי יכולה להיות סבון כלים ביתי.. חומרים אלה עוזרים לחטא את כל המיקרואורגניזמים הקיימים על הכלים ולנקות אותם לשימוש עתידי, ומספקים משטח היגייני ונקי. מלבד היותם זמינים בצורה של סבונים לשטיפת כלים, חיידקי חיטוי יכולים להיות גם בצורה של תרסיסים או מגבונים שטופלו בסבוני חיטוי חיטוי.
