אורגניזמים אנאירוביים הם לגמרי מול אורגניזמים אירוביים, הם לא משתמשים בחמצן diatomic לצמיחה, חילוף חומרים והבחנה, עבודה אלה עם תרכובת אחרת, נותנים מקום subclassification אם מיקרואורגניזמים אמר לעבוד עם תרכובת כימית המכונה פירובט אומר שלו מטבוליזם הוא תסיסה (הם משתמשים בתסיסה), לעומת זאת, זהו חומר אחר השונה מפירובט, אם כתוב שהוא אורגניזם העוסק בנשימה אנאירובית.
התסיסה מורכבת מהשגת אנרגיה כימית מתהליך קטבולי ומחמצון לא גמור או שלם של תרכובת אורגנית, על פי התוצר הסופי שלה ניתן לסווג אותה לתסיסה אלכוהולית מכיוון שהיא מייצרת אתנול, תסיסה לקטית מייצרת חומצה לקטית, תסיסה בוטירית, בין היתר; מבחינתו, נשימות אנאירוביות מורכבות משרשרת הובלה של אלקטרונים הדומה בדרך כלל לזו של נשימה אירובית, אך במקום שהמקבל הסופי הוא חמצן, במקרה זה תהיה כל תרכובת אנאורגנית.
כשם שישנם חיידקים אירוביים, קיימים גם חיידקים אנאירוביים אשר יכולים לחיות ללא חמצן, חלקם נמצאים בתוך גוף האדם במקומות בהם אין נוכחות של חמצן, כגון במעי הגס בו הם מתפקדים כחיידקים מוחלשים. חומר צואה, על פי עמידותו לחמצן, יכול להיות מסווג כ: חיידקים אנאירוביים חייבים , אלה אינם יכולים לגדול באזורים בהם יש נוכחות של חמצן מכיוון שהוא מזיק ויכול לגרום להשמדתו, חיידקים אווירוטולנטיים לעולם לא ישתמשו בחמצן לתהליכים המטבוליים שלהם. אבל יכול לחיות בסביבות מחומצן, אנאירובים פקולטטיבייםהם יכולים להשתמש בחמצן כמקבל האלקטרונים הסופי, אך אם הם נמצאים בסביבות שאין חמצן, הם משתמשים במסלול התסיסה.