רקמות מגן הן אלה שדואגות להגן על הצמח, לגלותו מבחוץ ומפגיעות חיצוניות אפשריות, אלו רקמות היוצרות שכבה חיצונית על הצמח כדי להגן על הצמח מפני גורמים חיצוניים כגון ייבוש, גשם, או אחרים העלולים להשפיע על התפתחותם. רקמת מגן מכונה גם אינטגומנט, היא נוצרת על ידי סדרת תאים המכסים את הצמח ומבודדים אותו מהסביבה. בשורשי הצמחים רקמה מסוג זה מתמחה ביצירת שערות סופגות המאפשרות לצמח לרכוש מים מהאדמה; מצדו העלה יוצר מעין שכבה האוטמת את הגבעולים או העליםכדי שלא יאבדו מים ובפנים העלים העור מבצע שינוי כדי לאפשר שינויים גזיים של פוטוסינתזה ונשימה, אך גם את הכללת אדי המים בזיעה.
בדי המגן ניתן לסווג לשני סוגים: האפידרמיס ואת suber או פקק.
האפידרמיס: מורכב מאותן רקמות המכסות את הגבעול והעלים; היא שכבה המורכבת ממכלול של תאים שטוחים המחוברים זה לזה כמו מדרכה, והקיר החיצוני מכוסה בקוטין, אטום מאוד, בעל ציטופלזמה תפקודית, ומאופיין גם בכך שאינו מכיל כלורופלסטים, ולכן הם אינם מבצעים את פוטוסינתזה. יש לו מבנים הנקראים stomata על מנת לאפשר מעבר גזים, שהוקמו על ידי תאים באופן דומה. אחד התפקידים העיקריים של רקמת האפידרמיס הוא להבטיח את ההגנה על הצמח, אולם זה גם מקל ומסדיר את חילופי החומרים.; לעיתים תאי האפידרמיס הופכים לשערות המונעות מהצמח לאבד חומרים אלה ומגינות עליו מפני חיכוך.
Suber: הרקמות suberous המכונה גם פקקים, אחראי החלפת אפידרמיס של גבעולים ושורשים כי יש יותר מ שנת חיים אחת, שכבה זו מורכבת מסדרה של המת או הלא-תפקודית תאים, ולכן אין להם הציטופלסמה חלקם, לעומת זאת, שומרים על קירות התא שלהם הסופגים בתת-סוברין, מה שהופך אותם למים. קירות אלה מכילים עדשים, שהם תעלות ריקות המאפשרות החלפת גזים עם האטמוספירה. התפקידים העיקריים של בדים תת-קרקעיים הם להרחיק את הצמח מטמפרטורות קיצוניות אפשריות, בנוסף לטיפול בו מפגיעות מכניות והפחתת זיעה.
