המונח חוסר סובלנות דתי מתייחס לסוג של חוסר סובלנות כלפי אמונות או פרקטיקות דתיות או, אם לא, היעדר המנהגים האמורים שיש לאדם או לקבוצה. זה יכול להיגרם ממספר גורמים, ביניהם ניתן להזכיר את העובדה שיש אמונות דתיות שונות, בעלי אידיאולוגיה שונה, כמו גם מהעובדה הפשוטה שיש רגש אנטי דתי. סוג זה של גישה יכול אפילו להוביל לתוקפנותפיזית, מילולית, פסיכולוגית, בין היתר. דוגמה מובהקת לסוג זה של חוסר סובלנות ברדיפה דתית שחווים באזורים שונים בעולם כיום. הסיבה העיקרית לכך שעמדות מסוג זה מצד החברה מתרחשות נובעת בעיקר מהיעדר סובלנות דתית, חופש דת ופלורליזם בכל הנוגע לדת.
חשוב לציין כי אין סיבה אחת המסבירה את חוסר הסובלנות הדתית, אולם ניתן לדבר על טיעון כללי מאוד בקרב העוסקים בדת אחת ואינם סובלניים כלפי אחרים. טענה זו פשוטה מאוד: באופן כללי, כולם רואים כי דתם היא האמיתית, מסיבה זו הוא נורמלי שהם סותרים את אלה המגנים על תורות כוזבות, מנקודת מבטם.
זו תופעה עתיקה כמו המקור הראוי של הדת. בימי קדם כאשר הנוצרים הראשונים ביצעו את טקסיהם, הם נאלצו להסתתר בקטקומבות מכיוון שהרשויות הרומיות של אז לא סבלו אמונות כאלה. מאז ימי קדם העם היהודי היה קורבן לרדיפה ברגעים רבים בתולדותיו והמניע העיקרי לרדיפה זו היה בדיוק העוינות כלפי המנהגים והאמונות שהם מחזיקים בו.
מצד שני, החזון הדתי של העמים הפרה-קולומביאניים נלחם על ידי הנוצרים כשהגיעו ליבשת אמריקה. גם בתוך הנצרות עצמה היו מקרים של חוסר סובלנות כלפי דוקטרינות נוצריות אחרות, שסווגו ככפירה או חריגה מהאמונה האותנטית. כל המקרים הללו שהוזכרו הם סימן לכך שדחייה וחוסר סובלנות לאמונותיהם של אחרים היו קבוע שהתרחש מאז ומעולם ונמשך עד עצם היום הזה.
