המונח קשר כימי משמש להתייחס לאיחוד הקיים בין שני אטומים (שיכולים להיות זהים או שונים) על מנת ליצור מולקולה. האטומים מורכבים של גרעין אטום עדיין מוקפים אלקטרונים (אשר יש מטען חשמלי שלילי). בקשר כימי יש את ההשתתפות בין האלקטרונים המרכיבים את האטומים השזורים זה בזה, מכיוון שבאמצעותם הקשרים מאוחדים, במונחים כימיים נאמר שמדובר בהעברת אלקטרונים בין אטומים, התופעה ש מתרחשת בקשר כימי.
בעולם שבו אנו חיים, רק גזים אצילים ומתכות במצב אדי נמצאים באופן טבעי כאטומים מבודדים, כלומר אטומים בודדים, שאינם מצטרפים ליצירת מולקולה, ולכן ניתן לומר שרוב אלמנטים שקיימים נוצרים על ידי קשרים כימיים, שנוצרים במטרה להשיג יציבות כימית. הקשרים נוצרים כתוצאה מהתנועה הקיימת בין אלקטרוני הערכיות של אטום, שהם האלקטרונים שנמצאים בקליפה החיצונית ביותר, כלומר אלה של רמת האנרגיה האחרונה, ברוב המקרים המטרה היא שיהיו שמונה אלקטרונים בענן האחרון הזה כדי להיות יציבים (מה שמבחינתם מתבטא בדומה לגז האצילי הכי קרוב שאפשר, בניסיון להעתיק את המבנה שלו).
מכיוון שהטבע של כל אטום שונה, ישנם גם סוגים שונים של קשרים כימיים, שהם: קשר יוני, סוג זה של קשר הוא על מתן או קבלת אלקטרונים, זה יכול להיות אחד או יותר. כאשר מועברים האלקטרונים האטום טעון באופן חיובי (נקרא קטיון יונים) וכאשר מקבלים אלקטרונים לאטום יש מטען שלילי גדול יותר (זה נקרא יון אניון), בקשר מסוג זה התופעה מתרחשתשיונים עם מטענים מנוגדים מושכים זה את זה. מאידך, קיים הקשר הקוולנטי, המתרחש כאשר אטומים חולקים אלקטרונים זה עם זה וההפרש האלקטרוני שלילי ביניהם הוא מינימלי, וקשרים מתכתיים, וקשרים באמצעות קשרי מימן.