מוסר ומצפון נקרא תהליך ההתבוננות הפנימי שבה האדם הוא מסוגל לנתח את היחס שהוא שומר ובנוסף, מנסה להטיל עונש מסוים כדי לתקן אותם. זה, במקרים קליניים רבים, הוא נעדר; חרטה, תוצאה של דיבור "קול המצפון הקטן" אינה ניכרת או אינה קיימת לחלוטין. עבור חלקם, המצפון המוסרי הוא ההוכחה הגדולה לכך שבן האדם הוא מאוד מסוגל ורציונלי, מה שיבדל אותנו משאר המינים הקיימים בממלכת החי. יש לציין כי טבעו של דבר הוא סובייקטיבי לחלוטין, מכיוון שהוא תוצר הנפש, בנוסף לחינוך ולרקע התרבותי שיש לאדם.
מוסר הוא אחד ההיבטים הרבים בחיי האדם שיש להם ערך רב לאנשים, שכן הוא מציין אם עמדותיהם, במסגרת הפרמטרים שלפיהם הועלו, נכונות או חסרות מוסר. ניתן להעביר צדקנות זו, עקב השפעת הסביבה החברתית בה נמצא הפרט, בנוסף לתרבות שחיה במקום; עם זאת, כמה ניואנסים ניתן לרכוש על ידי חוויותיו של האדם עצמו. מכאן יוגדרו לאדם ערכים מסוימים וכן יוגדרו ההחלטות שיוכלו לקבל בעתיד. יש שאף מרחיקים לכת ומאתרים את המקור לכך באמונות על טבעיות.
השערות שונות נוצרו לגבי אופן הפעולה של המצפון המוסרי. האינטלקטואליות המוסריות עולות כי זה הוא ידע הסיבה אשר יכול להראות לנו מה טוב ומה רע. אמוציונליות מצידה אומרת כי ניתוח והנמקה משתפים פעולה רק בתהליך באופן כללי, מכיוון שרגשות הם הגורם המכריע. בינתיים, האינטואיציזם, מאשר כי אף אחד מהאמור לעיל לא יסביר את תפקודה של תודעה זו, אלא שתהיה לו הבנה ישירה של טוב ורע. המרשמים, סוף סוף, מכתיבים שזה רק השיפוט של האדם שיכול לקבוע אם התנהגותם טובה או רעה.
